Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp6v0e1Q9CQD8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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