Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQC3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQC3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQC3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQC3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQC3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQC3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQC3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQC3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9CQC3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CQC3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CQC3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CQC3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CQC3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CQC3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CQC3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CQC3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CQC3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CQC3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CQC3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CQC3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CQC3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CQC3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CQC3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CQC3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q9CQC3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q9CQC3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CQC3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CQC3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms