Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS4

Prss29, Serine protease 29, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss29Q99MS4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prss29Q99MS4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms