Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clp1Q99LI9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clp1Q99LI9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms