Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms