Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms