Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pacsin3Q99JB8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pacsin3Q99JB8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms