Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms