Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms