Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hps3Q91VB4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms