Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms