Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms