Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ccdc58Q8R3Q6 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc58Q8R3Q6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc58Q8R3Q6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ccdc58Q8R3Q6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ccdc58Q8R3Q6 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ccdc58Q8R3Q6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ccdc58Q8R3Q6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ccdc58Q8R3Q6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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