Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms