Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc12Q8R344 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms