Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms