Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ssh3Q8K330 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ssh3Q8K330 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ssh3Q8K330 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ssh3Q8K330 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ssh3Q8K330 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssh3Q8K330 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ssh3Q8K330 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ssh3Q8K330 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssh3Q8K330 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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