Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf39Q8K2Z2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf39Q8K2Z2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms