Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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LgsnQ8CIX8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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LgsnQ8CIX8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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LgsnQ8CIX8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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LgsnQ8CIX8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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LgsnQ8CIX8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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LgsnQ8CIX8 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms