Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Ercc8Q8CFD5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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Ercc8Q8CFD5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Ercc8Q8CFD5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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