Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDS7

Uncharacterized protein C21orf140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDS7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CDS7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms