Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc38Q8CDN8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms