Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms