Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vcpip1Q8CDG3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcpip1Q8CDG3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcpip1Q8CDG3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcpip1Q8CDG3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcpip1Q8CDG3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcpip1Q8CDG3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcpip1Q8CDG3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcpip1Q8CDG3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcpip1Q8CDG3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcpip1Q8CDG3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcpip1Q8CDG3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcpip1Q8CDG3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcpip1Q8CDG3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcpip1Q8CDG3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcpip1Q8CDG3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcpip1Q8CDG3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcpip1Q8CDG3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcpip1Q8CDG3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcpip1Q8CDG3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcpip1Q8CDG3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcpip1Q8CDG3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcpip1Q8CDG3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcpip1Q8CDG3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcpip1Q8CDG3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcpip1Q8CDG3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcpip1Q8CDG3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms