Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cacnb2Q8CC27 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cacnb2Q8CC27 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cacnb2Q8CC27 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cacnb2Q8CC27 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cacnb2Q8CC27 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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