Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fbxo48Q8CAT8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms