Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc15Q8C9M2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc15Q8C9M2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms