Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dclre1bQ8C7W7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms