Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms