Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms