Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms