Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms