Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3Q8BRE0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms