Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gga3Q8BMI3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms