Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf3c2Q8BL74 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c2Q8BL74 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms