Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc2Q8BKV1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms