Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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Atg4bQ8BGE6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Atg4bQ8BGE6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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