Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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