Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms