Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

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Length 1,193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttll4Q80UG8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ttll4Q80UG8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ttll4Q80UG8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ttll4Q80UG8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ttll4Q80UG8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ttll4Q80UG8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ttll4Q80UG8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ttll4Q80UG8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ttll4Q80UG8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ttll4Q80UG8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ttll4Q80UG8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttll4Q80UG8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll4Q80UG8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll4Q80UG8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll4Q80UG8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ttll4Q80UG8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll4Q80UG8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll4Q80UG8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll4Q80UG8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll4Q80UG8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll4Q80UG8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll4Q80UG8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll4Q80UG8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll4Q80UG8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll4Q80UG8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll4Q80UG8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll4Q80UG8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll4Q80UG8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ttll4Q80UG8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll4Q80UG8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll4Q80UG8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll4Q80UG8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll4Q80UG8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll4Q80UG8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms