Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rexo1Q7TT28 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms