Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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