Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmed3Q78IS1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms