Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms