Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d2Q6PHS9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms