Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rad54bQ6PFE3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rad54bQ6PFE3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rad54bQ6PFE3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad54bQ6PFE3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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