Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtifQ6PEE2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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