Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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