Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttbk1Q6PCN3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms