Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms